Akuntabilitas perguruan tinggi pemerintah dilakukan melalui penentuan indikator kinerja kunci yang menunjukkan tingkat keberhasilan organisasi dalam mencapai rencana strategisnya. Penyusunan LAKIP sebagai sebuah laporan akuntabilitas instansi pemerintah memberikan kaidah-kaidah dalam menyusun pencapaain rencana strategis dengan mengidentifikasi indikator kinerja kunci bagi keberhasilan penyelenggara pendidikan tinggi. Studi lapangan dan analisis deskriptis periode 2003-2005 dilakukan untuk menilai tingkat kesesuaian LAKIP sebuah fakultas dengan pedoman dan kerangka Value for Money bagi organisasi sektor publik. Penilaian ditekankan pada substansi formulir LAKIP yang disusun, dimensi relevansi indikator kinerja kunci yang diidentifikasi pada laporan,  dan kepatuhan pada prinsip Value for Money. Hasil pengamatan menunjukkan bahwa LAKIP fakultas telah memadai dalam menentukan indikator kinerja kunci proses penyelenggaraan pendidikan tinggi, namun diperlukan perbaikan dalam konsistensi substansi formulir, relevansi indikator kinerja, dan kesesuaian dengan prinsip Value for Money.